Validierte Liquid-Biopsy-Lösung für ein umfassendes molekulares Tumorprofiling bei Patienten mit soliden Tumoren

>300† Gene, MSI, bTMB, TumorfraktionAnalysiert die vier Hauptklassen genetischer Veränderungen* in >300† krebsrelevanten Genen plus MSI, bTMB und Tumorfraktion1,2,4-10MinimalinvasivKlinischer NutzenQualitativHochwertigAusführlicherBerichtZwei Röhrchen mit 8,5 mlperipherem VollblutPatientenfreundlicheBlutabnahme ohne Biopsie1115Wenn eine Gewebebiopsie nichtdurchführbar oder für die Untersuchung unzureichend ist20,21Bei Krankheitsprogression22,23Europäische Zertifizierung(CE – IVD)Analytisch und klinischevalidierte Plattform‡3,16FDA Zulassung3Kann die klinische Entscheidungsfindung bei soliden Tumoren unterstützenErgebnisbericht in ca. 14 Tagen1
Gene und genomische Signaturen

Umfassende Liquid Biopsy detektiert alle vier Hauptklassen von Genveränderung in>300 Genen

TumorfraktionTumormutationslastim BlutBasensubstitutionInsertionDeletionKopienzahlvariationRekombinationMikrosatelliteninstabilitätMSIbTMBAnalysiert324bekanntekrebsrelevanteGene%

FoundationOne Liquid CDx detektiert die vier Hauptklassen der genomischen Veränderungen* in >300 Genen und weist den Status der Mikrosatelliteninstabilität (MSI)  sowie die Tumormutationslast im Blut (bTMB) aus.

Eine hohe Spezifität und Sensitivität sowie die Zertifizierung als in vitro Diagnostikum (CE-IVD) gewährleisten, dass Sie auf die gefundenen und im Bericht ausgewiesenen Alterationen vertrauen können.

Zudem wird die Tumorfraktion als Maß für die Wahrscheinlichkeit der Erkennung genomischer Veränderungen in der Flüssigbiopsie angezeigt.1-4

Klinische Anwendung

FoundationOne Liquid CDx eignet sich für alle soliden Tumoren

FoundationOne Liquid CDx detektiert die in Leitlinien empfohlenen sowie weitere mit der Entität assoziierte Alterationen beispielsweise bei NSCLC, Brustkrebs Ovarialkrebs.1,2,5–9
E G F R HER2 (ERBB2 ) B R CA 1 ME T PIK 3 C A AL K NTRK B R A F B R CA 2 RE T MS I R O S 1 B R CA 1 H E R2 (ERB B 2 ) B R CA 2 P ALB 2 Lunge Brust Ovar NTRK

FoundationOne Liquid zeigt einen klinischen Nutzen bei ALK+ Patienten im nicht kleinzelligen Lungenkarzinom (NSCLC)

Der klinische Nutzen einer Liquid Biopsy wurde in der BFAST Studie, einer globalen, prospektiven Kohortenstudie nachgewiesen. In dieser wurde ein FMI basierter Liquid Biopsy Asssay als einzige Methode zur Identifizierung genetischer Veränderungen bei NSCLC-Patienten als Grundlage für eine ALK+-basierte Therapie herangezogen.

FoundationOne Liquid CDx ist als Compagion Diagnostics (CDx) für die Detektion von ALK Mutationen von der FDA zugelassen.38

ALK+ prevalenceDer Anteil von Patienten, bei welchen eineALK+ Fusion mittels Liquid-Biopsy in der BFAST-Studie detektiert wurde, war hierbei vergleichbar zu den Ergebnissen an Gewebebiopsien aus einer Meta-Analyse.36,37 BFAST Liquid5.4%4.5%–6.4%Meta-analysisTissue

BFAST: Blood First Assay Screening Trial (Blood-First-Assay-Screening-Studie, NCT03178552); Für BFAST wurde FoundationACT, eine frühere Version des aktuellen Flüssigbiopsiedienstes von Foundation Medicine, FoundationOne Liquid CDx, verwendet. Der bei BFAST zur Messung von ALK+ verwendete Assay, der in FoundationOne Liquid CDx integriert wurde.

Wie kann FoundationOne Liquid CDx Sie bei der Krebsbehandlung unterstützen?

Liquid-Biopsy kann klinischen Nutzen schaffen...21, 24-30

  • … wenn Gewebe in Qualität bzw. Quantität unzureichend verfügbar ist.
  • … wenn eine Gewebebiopsie schwierig durchführbar ist oder ein hohes Risiko für den Patienten darstellt.
  • … um die Heterogenität metastasierter Erkrankungen besser zu erfassen.
  • … um die Krankheitsprogression/klonale Entwicklung bzw. das Auftreten von Rezidiven zu monitorieren.

Wenn Gewebe vorhanden ist, sollte FoundationOne CDx genutzt werden. Wenn eine Gewebebiopsie nicht durchführbar oder zu wenig Gewebe für die Untersuchung vorhanden ist und/oder eine Krankheitsprogression vermutet wird, steht FoundationOne Liquid CDx als Alternative zur Verfügung.20

VermutlicheKrankheitsprogressionBehandlungPatient mit solidem TumorEineeinzigeBlutprobeGewebebiopsie ist möglichGewebebiopsie nicht möglichWenn nicht genug Gewebe für eineUntersuchung mitFoundationOne CDx vorhanden ist
Validierung

Basiert auf der von der FDA zugelassenen Test-Plattform3,16

FoundationOne Liquid CDx basiert auf einer analytisch und klinisch validierten, von der FDA zugelassenen, Companion Diagnostic (CDx) Plattform. 

Die Validierung basiert auf über 7.500 Proben, in 37 Krebsindikationen und >300 Genen2. Dies entspricht einer 150-fachen Probenanzahl#, die für eine typische Validierung herangezogen werden.31,32

F1 Liquid CDx ist gemäß der Richtlinie 98/79/EG des Europäischen Parlaments und des Rates als allgemeines IVD-Medizinprodukt eingestuft. Der Assay trägt die CE-Kennzeichnung gemäß IVDD 98/79/EG und ist über Qarad, den bevollmächtigten Vertreter Foundation Medicine in der EU, registriert.33

Analytische ValidierungKlinische ValidierungBioinformatik

ctCNA

Sequenziert zirkulierende Tumor-DNA (ctDNA)

FoundationOne Liquid CDx sequenziert zirkulierende Tumor-DNA, die aus dem primären und metastatischen Tumorumfeld stammen kann. Dadurch kann Heterogenität der Erkrankung im Körper im Krankheitsverlauf erfasst werden.1,2
TumorgewebeApoptoseNekroseSekretionGesundes GewebeHauptquelle für zellfreieDNAFreisetzungzellfreier DNAApoptoseFreisetzungctDNAFreisetzung genomischerDNAwenn lysiertZirkulierendeZellen

Detaillierter Bericht

Der ausführliche Ergebnisbericht kann die klinische Entscheidungsfindung unterstützen

Ein übersichtlicher, detaillierter Bericht liefert Erkenntnisse über das molekulare Tumorprofil Ihrer Patienten sowie damit verbundene zielgerichtete Therapien, Immuntherapien und entsprechende klinische Studien.1,2

Die ausgewiesenen Therapien werden anhand der NCCN Kategorien bewertet. Weitere Informationen zu den NCCN Kategorien finden Sie im NCCN Compedium® unter www.nccn.org.

ORD-XXXXXXX-XXORDERED TEST #FRCOUNTRY CODEREPORT DATELung adenocarcinomaTUMOR TYPE999999999, FRPATIENT FoundationOnLiquid CDx is a next generation sequencing (NGS)assay that identies clinically relevant genomic alterations in circulating cell-freeDNA.ABOUT THE TESTLung adenocarcinomaDISEASE999999999, FRNAMENot GivenDATE OF BIRTHNot GivenSEXNot GivenMEDICAL RECORD #PATIENTNot GivenORDERING PHYSICIANNot GivenMEDICAL FACILITYNot GivenADDITIONAL RECIPIENTNot GivenMEDICAL FACILITY IDNot GivenPATHOLOGISTNot GivenSPECIMEN IDBloodSPECIMEN TYPENot GivenDATE OF COLLECTIONNot GivenSPECIMEN RECEIVEDPHYSICIANSPECIMEN0.20%exon 19 deletion (L747_A750>P)EGFR5 Muts/Mb1Afatinib1Erlotinib1Dacomitinib1Gefitinib1Osimertinibsee p. 1110 TrialsTHERAPY AND CLINICAL TRIAL IMPLICATIONSGENOMIC SIGNATURESBlood Tumor Mutational Burden -THERAPIES APPROVED IN THE EU(IN OTHER TUMOR TYPE)THERAPIES APPROVED IN THE EU(IN PATIENT'S TUMOR TYPE)GENE ALTERATIONSNo therapies or clinical trials.see Genomic Signatures sectionUnable to determine Microsatellite status due to insufficient evidence of genomicinstability.Tumor fraction is an estimate of the percentage of circulating-tumor DNA (ctDNA)present in a cell-free DNA (cfDNA) sample based on observed aneuploid instability.Cannot Be DeterminedMicrosatellite status13%Tumor FractionEGFR exon 19 deletion (L747_A750>P)TP53 R267PFor a complete list of the genes assayed, please refer to the Appendix.Gene AlterationsGenomic SignaturesCannot Be DeterminedMicrosatellite status5 Muts/MbBlood Tumor Mutational Burden13%Tumor FractionNCCN CategoryClinical Trials10Therapies with Lack of Response 0Therapies Approved in the EU5Electronically Signed by Julia A. Elvin, M.D., Ph.D. • 01 June 2020Julia Elvin, M.D., Ph.D., Laboratory Director CLIA: 22D2027531Shakti Ramkissoon, M.D., Ph.D., M. M. Sc, Laboratory Director CLIA: 34D2044309Foundation Medicine, Inc. • 1-888-988-3639Sample Preparation:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Sample Analysis:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Post-Sequencing Analysis:150 Second St., 1st Floor. Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531ofPAGEORD-XXXXXXX-XXORDERED TEST #REPORT DATELung adenocarcinomaTUMOR TYPE999999999, FRPATIENTp. 5GENE ALTERATIONS WITH NO REPORTABLE THERAPEUTIC OR CLINICAL TRIALS OPTIONSFor more information regarding biological and clinical signicance,including prognostic,diagnostic,germline,and potential chemosensitiviimplications,see the Gene Alterations section.TP53C242GNOTE Genomic alterations detected may be associated with activity of certain approved therapies; however, the therapies listed in this report may have varied clinical evidence in the patients tumor type.Therapies and the clinical trials listed in this report may not be complete and/or exhaustive. Neither the therapies nor the trials identified are ranked in order of potential or predicted efficacy for this patient,nor are they ranked in order of level of evidence for this patients tumor type. This report should be regardedand used as a supplementary source of information and not as the single basis for the making of atherapy decision. All treatment decisions remain the full and final responsibility of the treating physician and physicians should refer to approved prescribing information for all therapies. Therapiescontained in this report may have been approved through a centralized EU procedure or a national procedure in an EU Member State. Therapies, including but not limited to the following, have been approvednationally in some EU Member States but may not be available in your Member State: Tretinoin, Anastrozole, Bicalutamide, Cyproterone, Exemestane, Flutamide, Goserelin, Letrozole, Leuprorelin, andTriptorelin. The Summary of Product Characteristics of EU approved therapies are available at https://www.ema.europa.eu/en/medicines. The information available on EMA's website is updated in regularintervals but may not reflect the current status at any time. In the appropriate clinical context, germline testing of APC, BRCA1, BRCA2, BRIP1, MEN1, MLH1, MSH2, MSH6, MUTYH, NF2, PALB2, PMS2, PTEN,RAD51C, RAD51D, RB1, RET, SDHA, SDHB, SDHC, SDHD, SMAD4, STK11, TGFBR2, TP53, TSC1, TSC2, VHL, and WT1 is recommended.Electronically Signed by Julia A. Elvin, M.D., Ph.D. • 01 June 2020Julia Elvin, M.D., Ph.D., Laboratory Director CLIA: 22D2027531Shakti Ramkissoon, M.D., Ph.D., M. M. Sc, Laboratory Director CLIA: 34D2044309Foundation Medicine, Inc. • 1-888-988-3639Sample Preparation:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Sample Analysis:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Post-Sequencing Analysis:150 Second St., 1st Floor. Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531ofPAGEDetails zum Patienten und TumorprobebTMB und MSI Status zur Definition möglicher Immuntherapien Alphabetisches Ranking der Therapien nach NCCN Kategorien**12123456456Genomische Alterationen ohne assoziierte zielerichtete Therapie oder Möglichkeit für klinische Studie77Not DetectedBlood TumorMutational BurdenMicrosatellite statusTumor Fractionexon 19 deletion(L747_A750>P)EGFR0.20%Cannot Be Determined13.0%FoundationOne® Liquid CDx1 June 2020ORD-XXXXXXX-XX5 Muts/MbHISTORIC PATIENT FINDINGS1%increments0.5%incrementsC242GTP530.10%ORD-XXXXXXX-XXORDERED TEST #REPORT DATELung adenocarcinomaTUMOR TYPE999999999, FRPATIENT This comparison table refers only to genes and biomarkers assayed by prior FoundationOne®Liquid CDx, FoundationOne®Liquid, FoundationOne®, or FoundationOne®CDx tests. Up to five previous testsmay be shown. For some genes in FoundationOne Liquid CDx, only select exons are assayed. Therefore, an alteration found by a previous test may not have been confirmed despite overlapping gene lists.Please refer to the Appendix for the complete list of genes and exons assayed. The gene and biomarker list will be updated periodically to reflect new knowledge about cancer biology.As new scientific information becomes available, alterations that had previously been listed as Variants of Unknown Significance (VUS) may become reportable.Tissue Tumor Mutational Burden (TMB) and blood TMB (bTMB) are estimated from the number of synonymous and non-synonymous single-nucleotide variants (SNVs) and insertions and deletions (indels)per area of coding genome sampled, after the removal of known and likely oncogenic driver events and germline SNPs. Tissue TMB is calculated based on variants with an allele frequency of!5%, and bTMBis calculated based on variants with an allele frequency of!0.5%.Not Tested = not baited, not reported on test, or test preceded addition of biomarker or geneNot Detected = baited but not detected on testDetected = present ( = Cannot Be Determined = Sample is not of sufficient data quality to confidently determine biomarker statusNOTEElectronically Signed by Julia A. Elvin, M.D., Ph.D. • 01 June 2020Julia Elvin, M.D., Ph.D., Laboratory Director CLIA: 22D2027531Shakti Ramkissoon, M.D., Ph.D., M. M. Sc, Laboratory Director CLIA: 34D2044309Foundation Medicine, Inc. • 1-888-988-3639Sample Preparation:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Sample Analysis:150 Second St., 1st Floor, Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531Post-Sequencing Analysis:150 Second St., 1st Floor. Cambridge, MA 02141 • CLIA: 22D2027531ofPAGE8